El proyecto consiste en la construcción de un tramo de 4,97 km de plataforma ferroviaria correspondiente a la Línea de Alta Velocidad Bobadilla–Granada, diseñada para doble vía y una velocidad de circulación de hasta 300 km/h. El trazado discurre íntegramente por el término municipal de Loja.

El elemento principal del tramo es el túnel de Quejigares, que concentra cerca del 70% de la longitud total del proyecto. Se trata de un túnel de doble tubo, con vía única en cada tubo y una sección libre de 55 m², excluyendo andenes y vía. El túnel cruza bajo la autovía A-92 y presenta una longitud de 3.362 m en la vía derecha y 3.379 m en la vía izquierda.

El tramo incluye asimismo tres viaductos, entre los que destaca el viaducto del Arroyo de la Viñuela, una estructura de 344 m de longitud, distribuida en 10 vanos, que permite salvar el cauce manteniendo la continuidad geométrica y funcional de la línea.